長崎巡礼センターでは、長崎、外海、五島市、新上五島町に地域ステーションを設置し、それぞれにスタッフを設置して教会や地域とのコミュニケーションをはかり、訪れる人々に節度ある良き「ながさき巡礼」を体験してもらえるよう体制作りを行っています。